幕府有战事征召时由武奉行与幕府对接。

礼奉行主管家内礼仪以及武士文化类考核。吏奉行安排家内武士在家中的任职，其余九位奉行里的官吏皆由吏奉行推举给三大佬。

工奉行主管国内建设，包括基础建设和民事建设，国内居民修筑建筑都需要找工奉行登记。战时有打造武器之责。

商奉行主管领国内商业行为，督促商人们交税。刑奉行主要就是抓捕违反律法的事情，包括武士都可以抓。

这些适用于一万石以上的大名可用。

一万石以下的可以自行安排。

至于小笠原辉长这里就设立了秘密部门，部长就是饭纲信元统领，副部长为出蒲清種，以及伊贺国的守护仁木义政被小笠原辉长的条件降服，投靠了小笠原辉长。

以至于伊贺国的国人服部氏加入小笠原辉长的麾下。

服部氏出名的就是服部半藏了。

伊贺众由著名的“三上忍”统领，即服部、百地和藤林。

服部氏相当有名，因为他们志向高、眼界宽，敢于走出伊贺的崇山峻岭，去别处混饭吃，首领之一的服部半藏正成侍奉德川家康，屡建奇功，最终领八千石俸禄，成为产业较大的地主和政府官员。

服部正成，乃德川十六神将之一，又号称“鬼半藏”。

服部家是出自伊贺国的豪族。出侍室町幕府十二代将军足利义晴，室町幕府衰退后；父亲保长与松平清康（德川家康祖父）有来往而受清康征召，为赴松平家埋姓，改姓服部。

半藏麾下的伊贺同心兵士中有不少是伊贺忍者。因此流传至后世的印象中，服部半藏之名代表着德川氏有名的忍者军团。

1569年，挂川城攻战中，又协助本多重次落城。1572年，在三方原合战中再次立下大功，并得到家康的重赏。

1579年，家康的长子松平信康被迫在二吴城切腹。据说是已经被任命为天方山城守的服部半藏担当了信康的介错。

但是半藏整个过程都伏地大哭，连刀都不能举起。但这种说法没有足够的史料支持。

最重要的是1582年，本能寺之变爆发，织田信长因明智光秀叛变于本能寺战死。

当时家康受邀在堺市游览，正准备赶回京都接受信长新的款待，突然先发京都的家臣本多忠胜前来禀报：“主公，出事了……”家康注目服部半藏，半藏利用手下忍者，很快就查明了消息的准确性——作为忍者集团，为主家打探各地情报本是不需要特别分派的任务。

当时京都附近都是明智及其党羽的部队，还有很多趁乱袭击落难武士的“山伏”〔即山贼，但大多由农民兼任〕，家康此行目的本是游山玩水，所以随从只有十余人，根本无法保障自己的安全。

自度不免的家康当场就要自杀，却被半藏劝住了：“只要逃回三河国，就是咱们的地盘了。请交给属下吧，属下一定护送主公安全抵达！”

半藏所以会有如此自信，因为当时伊贺、甲贺的忍者集团都被织田信长剿灭，残余势力正藏在群山中嗷嗷待哺，半藏有把握将这些没饭吃的老乡招出来帮忙。

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因此商定的逃脱路线，是从京都附近的宇治川向西进入伊贺国，穿过伊贺的崇山峻岭，最后从伊贺国白子港坐船逃离。

德川家康迁都至江户城时，半藏负责江户城西门的警备、因此这个西门到德川幕府结束都还有‘半藏门’的称呼。

正成之长子正就在大坂城夏之阵之役战死，次子正重后来因事改易，服部家因而断绝。

但正成创建的德川忍者集团，日后成为幕府公仪隐密集团，为幕府监视诸侯举动的利器，对于德川江户政权二百多年的安定有